問い合わせ先: 〒755-8505　 山口県宇部市南小串1-1-1 山口大学総合科学実験センター 資源開発分野（遺伝子実験施設） Tel: 0836-22-2183（施設長室） 　　 0836-22-2184（研究室） Fax: 0836-22-2185 E-mail: (2022.10.21更新)

新着情報 *お知らせ* （2022.11.25） 遺伝子実験施設利用者のみなさまへ 2022年12月1日から2023年1月16日まで次世代シーケンス解析キャンペーンを実施します。 RNA-seq解析は、全遺伝子発現を高精度（相関係数0.995前後）に解析できます。 分解している場合でもリボマイナスRNA-seqかTranscriptime解析(ヒト・マウスのみ）を用いることで全遺伝子解析が可能です。 今年度、最後のキャンペーンになりますので、サンプルを解析をご検討されている方は、ぜひ御連絡ください。 １．RNA-seq解析 1サンプル3.9万円（RNA抽出・正規化までのデータ解析込み） RNAlaterに浸した組織あるいは細胞のペレットからDNase処理の高純度total RNAを抽出します。 抽出後、polyAを利用しmRNA全長を精製し、シーケンスすることで全遺伝子発現を解析します。 polyAを持たない生物種やRNAが分解している場合はリボゾーマルRNAを除去し、ランダムプライマーで逆転写します。 リボゾームRNA除去に追加費用（1サンプル7000円）が必要になります。 また、tRNAも解析するため、データ量は半分（2000万リード）になりますが、発現解析は可能です。 今回からホッピングの影響を除外するため、両末端にユニークなデュアルインデックス配列を挿入し解析します。 RNA-seq解析はNova-seq6000を持ちいて１リード50bpの解析で1サンプル当たり4000万程度のデータを算出します。 データは、正規化（TPMおよにRPKM)しエクセルファイルでご返却します。 サンプルの純度が悪い場合はNext-seqでの解析となり、１リード75bpで2000万リードになります、 ２．RNA Transcriptome解析　(旧SAGE解析） 1サンプル3.8万円（RNA抽出込み）3サンプル毎に1サンプル無償解析 ヒトかマウスに限定されますが、約2万以上の遺伝子に対してプライマーを設計し、次世代シーケンサ(Ion S5)で発現解析します。 発現しているほぼ全ての遺伝子に対してプライマーを設計しています。 短い断片を解析するので、RNAが分解していても解析が可能です。 新鮮な組織標本からの抽出物も解析できます。 共同研究の有無に関係なく、希望者には主成分分析および階層型クラスター分析の結果もご返却します。 RNA発現解析をご検討されている方は、ぜひ遺伝子実験施設(cgryu@yamaguchi-u.ac.jp)まで事前にご相談ください。 中国地方バイオネットワークに所属している大学は学内料金で解析します。 学外の方は事務手数料５％が必要になりますが、USBメモリーや輸送費などに充当します。 みなさまのご依頼をお待ちしています。 *お知らせ* （2022.11.11） 山口大学遺伝子実験施設利用者のみなさまへ 2022年11月14日（月）からオリゴDNAの注文方法が、ホームページからの発注に変更になります。 既に登録済みの方は、ファスマックの注文サイトに入っていただき、IDとパスワードを入力してください。 注文者毎のサイトがありますので、このサイトから発注をお願い致します。 まだ、登録されていない方は、遺伝子実験施設に事前登録のメールをお送りください。 ファスマックからID番号とパスワード取得先が表示されます。 必要事項をご記入いただければ、各自のメールアドレスにパスワードが届きます。 パスワードを紛失された方もパスワード取得のURLから入っていただければ再発行されます。 IDを忘れた方はメールアドレスでも注文サイトに入ることができます。 オリゴの受取方法や支払い請求は従来と同じです。 ホームページから発注後30分以内であれば、ホームページ上からキャンセルすることも出来ます。 ホームページから過去の注文を確認することもできます。 ご不明な点があれば遠慮なく、遺伝子実験施設までお問い合わせください。 どうぞよろしくお願い致します。 遺伝子実験施設への事前登録（エクセル書式）をメールで送る 事前登録用紙のダウンロード 遺伝子実験施設 ファスマックからID番号、パスワード取得先を受け取る ファスマックの注文サイト(https://www.bio.fasmac.co.jp/Unitcontract/ja-JP/Account/LoginContract.mvc?str=PNRAFyo3XCmsBPzcGbgHqhCeeg1TRkEoWQ7FepRZ73k=) にアクセスし、注文する。 ファスマックからmail着信の確認として、折り返し納期（出荷予定日）を返送 オリゴDNAを宅急便で受け取る 遺伝子実験施設からの請求書に従って支払いを行う校費、委任経理金の場合は３ヶ月毎に遺伝子実験施設から請求科研費の場合は注文毎に支払い（請求書を本人宛に送付） *お知らせ* （2022.9.15） 遺伝子実験施設利用者のみなさまへ いつも遺伝子実験施設をご利用いただきありがとうございます。 2022年9月15日から施設内に各自のUSBメモリや外付けHDDの持ち込みを禁止しています。 今後は、USB以外に大容量データを移動するための1TBのSSDメモリも準備致します。 SSDは、2階入口と3階入口のUSB貸出ボックスに準備しますので、USBメモリと同様に使用時にノートに記載してください。 SSDメモリを買い取る場合は18000円をご請求させていただきます。 保存したデータを施設内に持ち込む場合は、施設の初期化USBや初期化SSDを使用し、必ずウイルスチェックを行ってください。 USBメモリ貸出台にデータ持込みシートを準備しますので、持込時に記載してください。 ウイルスが見つかった場合は、全てのデータを消去することになりますので、十分にご注意ください。 どうぞよろしくお願い致します。 *お知らせ* （2021.1.19） 遺伝子実験施設利用者のみなさまへ 遺伝子実験施設・3階 細胞構造解析室のIN Cell Analyser (GEヘルスケア) について イニシャライズ時に不具合が発生し、使用できない状態になっています。 修理までの間しばらくお待ちください。 >>新着情報バックナンバー 研究成果 *共同獣医学部との共同研究の論文が受理されました。 （2022.7.19） Dimas Arya Abdillah et al, Age‐associated changes in gene expression in the anterior pituitary glands of female Japanese black cattle, Mammalian Genome, in press (2022), (IF=3.224) *ロート製薬、愛媛大学医学部との共同研究の論文が受理されました。 （2022.6.6） Hu, L. et al, Anti-inflammatory effects of differential molecular weight hyaluronic acids on UVB-induced calprotectin-mediated keratinocyte inflammation, J. Dermacol. Sci., in press (2022), (IF=4.563) *口腔外科との共同研究の論文が受理されました。 （2022.6.6） Harada, K., et al., An elemental diet protects mouse salivary glands from 5-fluorouracil-induced atrophy, Oncol Lett., 2022 Jun;23(6):178 (2022), (IF=2.967) *広島大学鈴木教授との共同研究論文が受理されました。 （2021.9.28） Xu, W., et al, Hydrogen sulfide suppresses the proliferation of intestinal epithelial cells through cell cycle arrest, Arch. Biochem. Biophys., in press (2021), (IF=3.391) *施設教員の共同研究論文が受理されました。 （2021.5.26） Shimizu, F., et al., GRP78 antibodies are associated with blood-brain barrier-breakdown in anti-myelin oligodendrocyte glycoprotein antibody-associated disorder, Neurology: Neuroimmunology & Neuroinflammation, in press (2021), (IF=7.724) >>研究成果バックナンバー